Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEFA5Q01523 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEFA5Q01523 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEFA5Q01523 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEFA5Q01523 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEFA5Q01523 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEFA5Q01523 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEFA5Q01523 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEFA5Q01523 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEFA5Q01523 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DEFA5Q01523 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DEFA5Q01523 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms