Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCN7AQ01118 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN7AQ01118 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN7AQ01118 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms