Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4GALNT1Q00973 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4GALNT1Q00973 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4GALNT1Q00973 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
B4GALNT1Q00973 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4GALNT1Q00973 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms