Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
MYBPC1Q00872 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYBPC1Q00872 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYBPC1Q00872 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYBPC1Q00872 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYBPC1Q00872 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYBPC1Q00872 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms