Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC42EP1Q00587 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDC42EP1Q00587 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC42EP1Q00587 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms