Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK16Q00536 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK16Q00536 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms