Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYP4F8P98187 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F8P98187 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F8P98187 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F8P98187 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F8P98187 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F8P98187 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms