Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG7P83436 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG7P83436 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG7P83436 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG7P83436 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG7P83436 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG7P83436 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG7P83436 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG7P83436 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG7P83436 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG7P83436 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG7P83436 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COG7P83436 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG7P83436 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG7P83436 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG7P83436 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG7P83436 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG7P83436 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG7P83436 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG7P83436 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG7P83436 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG7P83436 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG7P83436 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG7P83436 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG7P83436 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COG7P83436 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG7P83436 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COG7P83436 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG7P83436 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG7P83436 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG7P83436 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG7P83436 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG7P83436 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG7P83436 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG7P83436 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG7P83436 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG7P83436 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG7P83436 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG7P83436 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG7P83436 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG7P83436 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG7P83436 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG7P83436 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG7P83436 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COG7P83436 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COG7P83436 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG7P83436 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG7P83436 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG7P83436 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG7P83436 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG7P83436 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG7P83436 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG7P83436 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG7P83436 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG7P83436 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG7P83436 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG7P83436 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COG7P83436 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COG7P83436 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG7P83436 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG7P83436 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG7P83436 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG7P83436 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG7P83436 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG7P83436 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG7P83436 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG7P83436 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COG7P83436 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG7P83436 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG7P83436 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG7P83436 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COG7P83436 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG7P83436 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG7P83436 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COG7P83436 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms