Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX3P78415 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX3P78415 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX3P78415 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX3P78415 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX3P78415 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX3P78415 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX3P78415 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX3P78415 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX3P78415 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX3P78415 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX3P78415 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX3P78415 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX3P78415 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX3P78415 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX3P78415 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX3P78415 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX3P78415 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX3P78415 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX3P78415 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX3P78415 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX3P78415 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX3P78415 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX3P78415 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX3P78415 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX3P78415 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX3P78415 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX3P78415 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX3P78415 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX3P78415 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX3P78415 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX3P78415 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX3P78415 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX3P78415 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX3P78415 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX3P78415 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX3P78415 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX3P78415 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX3P78415 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX3P78415 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRX3P78415 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
IRX3P78415 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRX3P78415 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX3P78415 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX3P78415 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX3P78415 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX3P78415 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX3P78415 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX3P78415 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX3P78415 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX3P78415 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX3P78415 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX3P78415 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX3P78415 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX3P78415 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX3P78415 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX3P78415 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX3P78415 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX3P78415 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRX3P78415 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRX3P78415 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRX3P78415 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRX3P78415 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRX3P78415 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRX3P78415 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRX3P78415 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRX3P78415 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRX3P78415 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRX3P78415 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRX3P78415 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRX3P78415 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRX3P78415 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRX3P78415 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRX3P78415 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRX3P78415 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRX3P78415 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRX3P78415 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRX3P78415 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
IRX3P78415 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRX3P78415 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IRX3P78415 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IRX3P78415 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX3P78415 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX3P78415 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX3P78415 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX3P78415 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX3P78415 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX3P78415 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX3P78415 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX3P78415 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX3P78415 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX3P78415 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX3P78415 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX3P78415 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX3P78415 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX3P78415 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX3P78415 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX3P78415 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX3P78415 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX3P78415 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms