Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT83P78385 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT83P78385 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT83P78385 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT83P78385 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT83P78385 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT83P78385 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT83P78385 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT83P78385 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT83P78385 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT83P78385 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT83P78385 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT83P78385 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT83P78385 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT83P78385 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT83P78385 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT83P78385 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT83P78385 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT83P78385 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT83P78385 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT83P78385 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT83P78385 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT83P78385 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT83P78385 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT83P78385 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT83P78385 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT83P78385 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT83P78385 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT83P78385 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT83P78385 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT83P78385 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT83P78385 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT83P78385 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT83P78385 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT83P78385 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT83P78385 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT83P78385 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT83P78385 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT83P78385 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT83P78385 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT83P78385 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT83P78385 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT83P78385 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT83P78385 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT83P78385 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT83P78385 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT83P78385 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT83P78385 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT83P78385 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT83P78385 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT83P78385 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT83P78385 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT83P78385 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT83P78385 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT83P78385 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT83P78385 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT83P78385 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT83P78385 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT83P78385 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT83P78385 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT83P78385 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT83P78385 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT83P78385 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT83P78385 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT83P78385 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT83P78385 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT83P78385 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT83P78385 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT83P78385 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT83P78385 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT83P78385 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT83P78385 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT83P78385 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT83P78385 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT83P78385 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT83P78385 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT83P78385 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT83P78385 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT83P78385 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT83P78385 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT83P78385 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT83P78385 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT83P78385 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT83P78385 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT83P78385 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT83P78385 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT83P78385 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms