Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP1P78357 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CNTNAP1P78357 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP1P78357 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms