Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RACK1P63244 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RACK1P63244 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RACK1P63244 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RACK1P63244 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RACK1P63244 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RACK1P63244 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RACK1P63244 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RACK1P63244 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RACK1P63244 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RACK1P63244 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RACK1P63244 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RACK1P63244 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RACK1P63244 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RACK1P63244 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RACK1P63244 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RACK1P63244 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RACK1P63244 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RACK1P63244 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RACK1P63244 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RACK1P63244 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RACK1P63244 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RACK1P63244 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RACK1P63244 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RACK1P63244 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RACK1P63244 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RACK1P63244 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RACK1P63244 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RACK1P63244 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RACK1P63244 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RACK1P63244 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RACK1P63244 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RACK1P63244 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RACK1P63244 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RACK1P63244 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RACK1P63244 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RACK1P63244 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RACK1P63244 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RACK1P63244 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RACK1P63244 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RACK1P63244 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RACK1P63244 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RACK1P63244 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RACK1P63244 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RACK1P63244 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RACK1P63244 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RACK1P63244 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RACK1P63244 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RACK1P63244 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RACK1P63244 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RACK1P63244 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RACK1P63244 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RACK1P63244 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RACK1P63244 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RACK1P63244 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RACK1P63244 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RACK1P63244 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RACK1P63244 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RACK1P63244 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RACK1P63244 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RACK1P63244 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RACK1P63244 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RACK1P63244 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RACK1P63244 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RACK1P63244 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RACK1P63244 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RACK1P63244 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RACK1P63244 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RACK1P63244 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RACK1P63244 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RACK1P63244 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RACK1P63244 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RACK1P63244 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RACK1P63244 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RACK1P63244 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RACK1P63244 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RACK1P63244 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RACK1P63244 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RACK1P63244 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RACK1P63244 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RACK1P63244 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RACK1P63244 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RACK1P63244 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RACK1P63244 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RACK1P63244 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RACK1P63244 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RACK1P63244 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms