Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMC6P62333 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMC6P62333 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMC6P62333 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PSMC6P62333 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PSMC6P62333 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMC6P62333 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMC6P62333 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms