Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNRPD3P62318 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNRPD3P62318 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms