Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TSPAN5P62079 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSPAN5P62079 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms