Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS3AP61247 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPS3AP61247 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms