Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF3P61204 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF3P61204 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF3P61204 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF3P61204 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF3P61204 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF3P61204 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF3P61204 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF3P61204 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF3P61204 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF3P61204 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF3P61204 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF3P61204 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF3P61204 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF3P61204 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF3P61204 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF3P61204 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF3P61204 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF3P61204 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF3P61204 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF3P61204 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF3P61204 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF3P61204 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF3P61204 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF3P61204 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF3P61204 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF3P61204 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF3P61204 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARF3P61204 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARF3P61204 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARF3P61204 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF3P61204 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF3P61204 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF3P61204 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF3P61204 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF3P61204 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF3P61204 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF3P61204 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF3P61204 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF3P61204 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF3P61204 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF3P61204 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF3P61204 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF3P61204 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF3P61204 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF3P61204 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF3P61204 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF3P61204 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF3P61204 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF3P61204 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF3P61204 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF3P61204 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF3P61204 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF3P61204 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF3P61204 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF3P61204 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF3P61204 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF3P61204 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF3P61204 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms