Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVFC1P60507 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVFC1P60507 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVFC1P60507 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms