Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSX2P58304 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSX2P58304 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSX2P58304 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSX2P58304 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSX2P58304 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSX2P58304 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VSX2P58304 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSX2P58304 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VSX2P58304 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSX2P58304 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSX2P58304 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSX2P58304 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSX2P58304 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSX2P58304 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSX2P58304 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSX2P58304 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSX2P58304 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSX2P58304 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSX2P58304 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSX2P58304 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSX2P58304 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VSX2P58304 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSX2P58304 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSX2P58304 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSX2P58304 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSX2P58304 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSX2P58304 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSX2P58304 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSX2P58304 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSX2P58304 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSX2P58304 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSX2P58304 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSX2P58304 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSX2P58304 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSX2P58304 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSX2P58304 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VSX2P58304 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSX2P58304 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSX2P58304 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSX2P58304 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSX2P58304 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSX2P58304 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSX2P58304 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSX2P58304 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSX2P58304 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSX2P58304 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSX2P58304 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSX2P58304 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSX2P58304 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSX2P58304 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms