Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEFSECP57772 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEFSECP57772 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEFSECP57772 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms