Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBASH3AP57075 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
UBASH3AP57075 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 977.7 ms