Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX10P56693 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX10P56693 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX10P56693 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOX10P56693 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOX10P56693 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX10P56693 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX10P56693 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX10P56693 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX10P56693 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX10P56693 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX10P56693 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX10P56693 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOX10P56693 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOX10P56693 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOX10P56693 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX10P56693 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX10P56693 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX10P56693 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX10P56693 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX10P56693 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX10P56693 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX10P56693 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX10P56693 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX10P56693 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX10P56693 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX10P56693 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX10P56693 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX10P56693 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX10P56693 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX10P56693 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX10P56693 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX10P56693 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX10P56693 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX10P56693 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX10P56693 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX10P56693 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX10P56693 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SOX10P56693 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOX10P56693 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOX10P56693 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX10P56693 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX10P56693 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX10P56693 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX10P56693 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX10P56693 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX10P56693 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX10P56693 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX10P56693 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX10P56693 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX10P56693 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX10P56693 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX10P56693 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX10P56693 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX10P56693 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX10P56693 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX10P56693 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX10P56693 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX10P56693 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX10P56693 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX10P56693 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX10P56693 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX10P56693 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX10P56693 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX10P56693 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX10P56693 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX10P56693 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX10P56693 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX10P56693 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX10P56693 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX10P56693 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX10P56693 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX10P56693 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX10P56693 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX10P56693 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX10P56693 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX10P56693 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX10P56693 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX10P56693 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX10P56693 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX10P56693 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX10P56693 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX10P56693 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX10P56693 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX10P56693 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX10P56693 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX10P56693 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX10P56693 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms