Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH13P55290 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH13P55290 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH13P55290 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH13P55290 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH13P55290 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH13P55290 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH13P55290 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH13P55290 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH13P55290 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH13P55290 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH13P55290 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH13P55290 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH13P55290 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH13P55290 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH13P55290 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH13P55290 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH13P55290 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH13P55290 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH13P55290 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH13P55290 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH13P55290 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH13P55290 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH13P55290 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH13P55290 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH13P55290 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH13P55290 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH13P55290 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH13P55290 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH13P55290 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH13P55290 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH13P55290 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH13P55290 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH13P55290 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH13P55290 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH13P55290 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH13P55290 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH13P55290 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH13P55290 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH13P55290 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH13P55290 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH13P55290 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH13P55290 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH13P55290 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH13P55290 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH13P55290 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH13P55290 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH13P55290 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH13P55290 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH13P55290 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH13P55290 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH13P55290 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH13P55290 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH13P55290 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH13P55290 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH13P55290 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH13P55290 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH13P55290 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH13P55290 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH13P55290 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH13P55290 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH13P55290 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH13P55290 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH13P55290 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH13P55290 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH13P55290 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH13P55290 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH13P55290 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH13P55290 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH13P55290 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH13P55290 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH13P55290 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH13P55290 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH13P55290 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH13P55290 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH13P55290 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH13P55290 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH13P55290 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH13P55290 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH13P55290 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH13P55290 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH13P55290 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH13P55290 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH13P55290 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH13P55290 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH13P55290 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms