Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB3P54753 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB3P54753 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB3P54753 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms