Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
YARSP54577 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YARSP54577 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YARSP54577 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YARSP54577 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YARSP54577 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YARSP54577 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YARSP54577 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YARSP54577 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YARSP54577 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YARSP54577 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YARSP54577 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YARSP54577 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YARSP54577 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YARSP54577 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YARSP54577 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
YARSP54577 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YARSP54577 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YARSP54577 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
YARSP54577 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YARSP54577 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YARSP54577 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YARSP54577 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YARSP54577 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YARSP54577 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YARSP54577 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YARSP54577 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YARSP54577 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YARSP54577 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YARSP54577 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YARSP54577 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YARSP54577 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YARSP54577 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YARSP54577 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YARSP54577 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YARSP54577 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YARSP54577 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YARSP54577 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YARSP54577 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YARSP54577 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YARSP54577 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YARSP54577 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YARSP54577 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
YARSP54577 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YARSP54577 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YARSP54577 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YARSP54577 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YARSP54577 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YARSP54577 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YARSP54577 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YARSP54577 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YARSP54577 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YARSP54577 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
YARSP54577 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YARSP54577 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YARSP54577 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YARSP54577 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YARSP54577 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YARSP54577 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YARSP54577 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YARSP54577 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YARSP54577 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YARSP54577 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YARSP54577 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YARSP54577 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YARSP54577 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YARSP54577 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YARSP54577 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YARSP54577 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
YARSP54577 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YARSP54577 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YARSP54577 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YARSP54577 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YARSP54577 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YARSP54577 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YARSP54577 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YARSP54577 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.5 ms