Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATXN3P54252 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATXN3P54252 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN3P54252 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN3P54252 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN3P54252 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN3P54252 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN3P54252 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN3P54252 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATXN3P54252 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN3P54252 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATXN3P54252 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms