Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRAP54198 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRAP54198 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRAP54198 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIRAP54198 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRAP54198 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRAP54198 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRAP54198 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRAP54198 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIRAP54198 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRAP54198 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRAP54198 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRAP54198 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRAP54198 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRAP54198 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRAP54198 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRAP54198 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRAP54198 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRAP54198 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRAP54198 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRAP54198 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRAP54198 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRAP54198 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRAP54198 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRAP54198 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRAP54198 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRAP54198 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRAP54198 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRAP54198 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRAP54198 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRAP54198 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRAP54198 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRAP54198 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRAP54198 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRAP54198 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRAP54198 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRAP54198 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRAP54198 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRAP54198 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRAP54198 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRAP54198 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRAP54198 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRAP54198 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRAP54198 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRAP54198 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRAP54198 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRAP54198 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRAP54198 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRAP54198 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRAP54198 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRAP54198 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRAP54198 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRAP54198 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRAP54198 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRAP54198 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRAP54198 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRAP54198 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRAP54198 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIRAP54198 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HIRAP54198 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HIRAP54198 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRAP54198 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRAP54198 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HIRAP54198 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRAP54198 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRAP54198 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIRAP54198 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRAP54198 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRAP54198 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRAP54198 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRAP54198 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HIRAP54198 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRAP54198 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRAP54198 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRAP54198 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRAP54198 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIRAP54198 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRAP54198 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRAP54198 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRAP54198 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRAP54198 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRAP54198 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRAP54198 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRAP54198 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRAP54198 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRAP54198 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRAP54198 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIRAP54198 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRAP54198 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRAP54198 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRAP54198 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRAP54198 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRAP54198 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRAP54198 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIRAP54198 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRAP54198 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRAP54198 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRAP54198 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRAP54198 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIRAP54198 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms