Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA8P53708 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA8P53708 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA8P53708 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms