Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK1P53667 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIMK1P53667 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms