Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARFIP2P53365 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFIP2P53365 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms