Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST1P52848 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST1P52848 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NDST1P52848 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NDST1P52848 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST1P52848 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST1P52848 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST1P52848 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST1P52848 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST1P52848 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST1P52848 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDST1P52848 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDST1P52848 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDST1P52848 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDST1P52848 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDST1P52848 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDST1P52848 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST1P52848 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST1P52848 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST1P52848 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST1P52848 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST1P52848 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST1P52848 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDST1P52848 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDST1P52848 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDST1P52848 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDST1P52848 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDST1P52848 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDST1P52848 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NDST1P52848 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NDST1P52848 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NDST1P52848 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDST1P52848 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDST1P52848 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST1P52848 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST1P52848 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST1P52848 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST1P52848 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST1P52848 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST1P52848 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST1P52848 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST1P52848 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST1P52848 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST1P52848 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDST1P52848 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST1P52848 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST1P52848 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDST1P52848 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NDST1P52848 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NDST1P52848 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NDST1P52848 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDST1P52848 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NDST1P52848 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NDST1P52848 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NDST1P52848 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NDST1P52848 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDST1P52848 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDST1P52848 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDST1P52848 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDST1P52848 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NDST1P52848 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDST1P52848 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDST1P52848 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDST1P52848 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDST1P52848 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDST1P52848 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDST1P52848 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDST1P52848 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDST1P52848 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDST1P52848 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NDST1P52848 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDST1P52848 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDST1P52848 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDST1P52848 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDST1P52848 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDST1P52848 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NDST1P52848 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDST1P52848 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDST1P52848 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDST1P52848 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDST1P52848 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDST1P52848 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDST1P52848 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDST1P52848 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDST1P52848 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDST1P52848 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDST1P52848 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDST1P52848 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDST1P52848 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDST1P52848 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDST1P52848 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDST1P52848 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDST1P52848 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDST1P52848 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDST1P52848 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NDST1P52848 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDST1P52848 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDST1P52848 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDST1P52848 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NDST1P52848 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms