Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2A1P52655 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms