Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEK4P51957 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEK4P51957 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEK4P51957 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEK4P51957 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEK4P51957 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK4P51957 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK4P51957 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK4P51957 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK4P51957 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK4P51957 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK4P51957 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK4P51957 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK4P51957 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK4P51957 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK4P51957 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK4P51957 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK4P51957 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK4P51957 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK4P51957 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK4P51957 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK4P51957 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK4P51957 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK4P51957 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK4P51957 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK4P51957 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK4P51957 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK4P51957 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK4P51957 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK4P51957 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK4P51957 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK4P51957 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK4P51957 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK4P51957 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK4P51957 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK4P51957 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NEK4P51957 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEK4P51957 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEK4P51957 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEK4P51957 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK4P51957 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK4P51957 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK4P51957 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK4P51957 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK4P51957 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK4P51957 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK4P51957 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK4P51957 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK4P51957 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK4P51957 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK4P51957 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK4P51957 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK4P51957 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK4P51957 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK4P51957 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK4P51957 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK4P51957 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK4P51957 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK4P51957 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK4P51957 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK4P51957 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK4P51957 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK4P51957 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK4P51957 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK4P51957 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK4P51957 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK4P51957 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK4P51957 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK4P51957 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK4P51957 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NEK4P51957 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK4P51957 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK4P51957 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK4P51957 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK4P51957 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK4P51957 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK4P51957 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK4P51957 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEK4P51957 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEK4P51957 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEK4P51957 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEK4P51957 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEK4P51957 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK4P51957 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK4P51957 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK4P51957 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK4P51957 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK4P51957 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK4P51957 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms