Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB28P51157 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB28P51157 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB28P51157 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB28P51157 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB28P51157 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB28P51157 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB28P51157 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB28P51157 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB28P51157 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB28P51157 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB28P51157 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB28P51157 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB28P51157 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB28P51157 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB28P51157 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB28P51157 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB28P51157 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB28P51157 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB28P51157 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB28P51157 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB28P51157 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB28P51157 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB28P51157 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB28P51157 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB28P51157 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB28P51157 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB28P51157 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB28P51157 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB28P51157 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB28P51157 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB28P51157 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB28P51157 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB28P51157 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB28P51157 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB28P51157 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB28P51157 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB28P51157 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB28P51157 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB28P51157 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB28P51157 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB28P51157 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB28P51157 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB28P51157 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB28P51157 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB28P51157 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB28P51157 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB28P51157 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB28P51157 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB28P51157 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB28P51157 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB28P51157 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB28P51157 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB28P51157 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB28P51157 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB28P51157 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB28P51157 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB28P51157 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB28P51157 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB28P51157 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB28P51157 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB28P51157 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB28P51157 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB28P51157 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB28P51157 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB28P51157 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB28P51157 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB28P51157 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB28P51157 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB28P51157 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB28P51157 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB28P51157 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB28P51157 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB28P51157 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB28P51157 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB28P51157 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB28P51157 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB28P51157 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB28P51157 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB28P51157 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB28P51157 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB28P51157 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB28P51157 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB28P51157 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB28P51157 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB28P51157 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB28P51157 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB28P51157 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB28P51157 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB28P51157 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB28P51157 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB28P51157 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB28P51157 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB28P51157 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB28P51157 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB28P51157 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB28P51157 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB28P51157 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB28P51157 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB28P51157 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms