Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARRES1P49788 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARRES1P49788 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RARRES1P49788 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RARRES1P49788 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RARRES1P49788 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RARRES1P49788 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARRES1P49788 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARRES1P49788 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RARRES1P49788 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARRES1P49788 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARRES1P49788 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARRES1P49788 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARRES1P49788 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms