Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLK2P49760 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLK2P49760 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLK2P49760 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLK2P49760 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLK2P49760 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLK2P49760 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLK2P49760 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLK2P49760 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLK2P49760 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK2P49760 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK2P49760 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK2P49760 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK2P49760 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK2P49760 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK2P49760 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK2P49760 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK2P49760 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK2P49760 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK2P49760 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLK2P49760 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLK2P49760 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLK2P49760 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLK2P49760 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLK2P49760 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLK2P49760 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLK2P49760 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK2P49760 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLK2P49760 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLK2P49760 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLK2P49760 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLK2P49760 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLK2P49760 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLK2P49760 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLK2P49760 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLK2P49760 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLK2P49760 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLK2P49760 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLK2P49760 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLK2P49760 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLK2P49760 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK2P49760 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLK2P49760 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLK2P49760 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLK2P49760 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLK2P49760 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLK2P49760 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLK2P49760 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLK2P49760 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLK2P49760 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLK2P49760 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CLK2P49760 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK2P49760 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK2P49760 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK2P49760 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK2P49760 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK2P49760 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK2P49760 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK2P49760 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK2P49760 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLK2P49760 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLK2P49760 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLK2P49760 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLK2P49760 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLK2P49760 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLK2P49760 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLK2P49760 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLK2P49760 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLK2P49760 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLK2P49760 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLK2P49760 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLK2P49760 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLK2P49760 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLK2P49760 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLK2P49760 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLK2P49760 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLK2P49760 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLK2P49760 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms