Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRIM2P49643 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRIM2P49643 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms