Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 CCDC144NL-AS1-212ENST00000580056 521 ntTSL 417.16■□□□□ 0.348e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TNPO2-208ENST00000587654 575 ntTSL 417.13■□□□□ 0.338e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 517.13■□□□□ 0.338e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.328e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.328e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSI2-205ENST00000577241 710 ntTSL 317.03■□□□□ 0.328e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.318e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SETD5-212ENST00000450326 921 ntTSL 316.95■□□□□ 0.38e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-213ENST00000524895 401 ntTSL 416.95■□□□□ 0.38e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.38e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFB2-205ENST00000464564 469 ntTSL 516.94■□□□□ 0.38e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.38e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF571-AS1-207ENST00000589802 434 ntTSL 316.86■□□□□ 0.298e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.288e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.288e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF571-AS1-208ENST00000590838 2511 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.278e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.278e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-209ENST00000564311 870 ntTSL 516.74■□□□□ 0.278e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.278e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ESRRB-206ENST00000512784 1826 ntTSL 516.73■□□□□ 0.275e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SPEG-220ENST00000485813 9854 ntTSL 516.72■□□□□ 0.278e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.268e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.268e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.268e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 316.62■□□□□ 0.258e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-213ENST00000568411 599 ntTSL 316.61■□□□□ 0.258e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TNPO2-205ENST00000586775 945 ntTSL 316.59■□□□□ 0.258e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-212ENST00000484849 1597 ntTSL 1 (best)16.55■□□□□ 0.248e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.248e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.248e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.238e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.228e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.28e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.28e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CSNK2A1-205ENST00000460062 552 ntTSL 416.21■□□□□ 0.198e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CSNK2A1-209ENST00000609606 589 ntTSL 216.21■□□□□ 0.198e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CSNK2A1-206ENST00000608066 577 ntTSL 416.21■□□□□ 0.198e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TGIF2-204ENST00000558028 638 ntTSL 216.15■□□□□ 0.188e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.178e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.178e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.178e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-207ENST00000562690 582 ntTSL 216.09■□□□□ 0.178e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 516.07■□□□□ 0.168e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ADGRD1-209ENST00000540207 718 ntTSL 316.04■□□□□ 0.168e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF571-AS1-211ENST00000592392 760 ntTSL 316.03■□□□□ 0.168e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.158e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.158e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.148e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.148e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.128e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSI2-207ENST00000579205 500 ntTSL 415.78■□□□□ 0.128e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.118e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-209ENST00000450110 716 ntTSL 315.68■□□□□ 0.18e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 C17orf99-205ENST00000586999 379 ntTSL 215.67■□□□□ 0.18e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.18e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.098e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STRN4-203ENST00000435164 1551 ntTSL 215.6■□□□□ 0.098e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.098e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.088e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.068e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.068e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SH3GL1-203ENST00000593591 1036 ntTSL 415.37■□□□□ 0.058e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STRN4-209ENST00000594704 913 ntTSL 515.36■□□□□ 0.058e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-204ENST00000561855 672 ntTSL 515.34■□□□□ 0.058e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CASP2-202ENST00000350623 1146 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.048e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EHMT1-244ENST00000637655 100 ntTSL 515.24■□□□□ 0.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EHMT1-220ENST00000626216 558 ntTSL 315.23■□□□□ 0.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.028e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SDCCAG8-202ENST00000435549 1551 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.028e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-220ENST00000532375 518 ntTSL 515.13■□□□□ 0.018e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 GATD1-211ENST00000529966 800 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.018e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.018e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STRN4-220ENST00000600710 565 ntTSL 515.06■□□□□ 08e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STRN4-214ENST00000597021 582 ntTSL 315.03■□□□□ -08e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 THOC5-205ENST00000414902 484 ntTSL 515.03■□□□□ -08e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ACAP3-203ENST00000354980 582 ntTSL 515.01□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PTK2B-208ENST00000495097 270 ntTSL 314.97□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PSD4-204ENST00000418251 5600 ntTSL 514.95□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 GATD1-214ENST00000532839 559 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 R3HDM4-207ENST00000591829 823 ntTSL 514.9□□□□□ -0.028e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SETD5-207ENST00000415650 579 ntTSL 414.85□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CPEB1-202ENST00000566716 502 ntTSL 314.84□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ACVR1-206ENST00000424669 550 ntTSL 414.79□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.058e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CPEB1-201ENST00000563519 536 ntTSL 414.68□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RRM2B-204ENST00000517517 573 ntTSL 414.63□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ADGRD1-204ENST00000446583 5529 ntTSL 514.55□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PTK2B-202ENST00000397497 3161 ntTSL 214.51□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ESRRB-202ENST00000505752 2432 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.18e-6■■■■■ 52.4
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 260.9 ms