Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RXRGP48443 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RXRGP48443 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RXRGP48443 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RXRGP48443 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RXRGP48443 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RXRGP48443 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RXRGP48443 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RXRGP48443 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RXRGP48443 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RXRGP48443 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RXRGP48443 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RXRGP48443 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RXRGP48443 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RXRGP48443 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RXRGP48443 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RXRGP48443 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RXRGP48443 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RXRGP48443 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RXRGP48443 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RXRGP48443 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RXRGP48443 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RXRGP48443 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RXRGP48443 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RXRGP48443 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RXRGP48443 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RXRGP48443 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RXRGP48443 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RXRGP48443 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RXRGP48443 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RXRGP48443 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RXRGP48443 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RXRGP48443 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RXRGP48443 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RXRGP48443 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RXRGP48443 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RXRGP48443 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RXRGP48443 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RXRGP48443 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RXRGP48443 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RXRGP48443 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RXRGP48443 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RXRGP48443 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RXRGP48443 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RXRGP48443 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RXRGP48443 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RXRGP48443 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RXRGP48443 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RXRGP48443 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RXRGP48443 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RXRGP48443 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RXRGP48443 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RXRGP48443 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RXRGP48443 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RXRGP48443 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RXRGP48443 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RXRGP48443 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RXRGP48443 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RXRGP48443 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RXRGP48443 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RXRGP48443 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RXRGP48443 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RXRGP48443 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RXRGP48443 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RXRGP48443 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RXRGP48443 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RXRGP48443 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RXRGP48443 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RXRGP48443 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RXRGP48443 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RXRGP48443 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RXRGP48443 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RXRGP48443 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RXRGP48443 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RXRGP48443 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RXRGP48443 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RXRGP48443 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RXRGP48443 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms