Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX9P48436 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX9P48436 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX9P48436 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX9P48436 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX9P48436 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX9P48436 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX9P48436 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX9P48436 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX9P48436 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX9P48436 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX9P48436 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX9P48436 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX9P48436 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX9P48436 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX9P48436 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX9P48436 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX9P48436 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX9P48436 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX9P48436 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX9P48436 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX9P48436 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX9P48436 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX9P48436 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX9P48436 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX9P48436 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX9P48436 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX9P48436 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX9P48436 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX9P48436 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX9P48436 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX9P48436 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX9P48436 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX9P48436 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX9P48436 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX9P48436 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX9P48436 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX9P48436 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX9P48436 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX9P48436 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX9P48436 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX9P48436 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX9P48436 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX9P48436 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX9P48436 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX9P48436 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX9P48436 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX9P48436 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX9P48436 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOX9P48436 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX9P48436 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX9P48436 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX9P48436 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX9P48436 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX9P48436 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX9P48436 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX9P48436 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX9P48436 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX9P48436 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX9P48436 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX9P48436 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX9P48436 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX9P48436 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX9P48436 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX9P48436 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX9P48436 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX9P48436 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX9P48436 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX9P48436 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX9P48436 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX9P48436 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX9P48436 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX9P48436 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX9P48436 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX9P48436 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX9P48436 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX9P48436 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX9P48436 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX9P48436 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX9P48436 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX9P48436 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SOX9P48436 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX9P48436 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SOX9P48436 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SOX9P48436 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX9P48436 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX9P48436 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX9P48436 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX9P48436 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX9P48436 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX9P48436 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX9P48436 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX9P48436 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX9P48436 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX9P48436 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX9P48436 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX9P48436 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX9P48436 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX9P48436 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX9P48436 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms