Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA4P48058 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIA4P48058 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA4P48058 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms