Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNJ1P48048 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNJ1P48048 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNJ1P48048 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms