Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZBP47756 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZBP47756 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms