Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF4P43489 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF4P43489 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms