Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP3P42574 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP3P42574 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP3P42574 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP3P42574 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP3P42574 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP3P42574 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP3P42574 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP3P42574 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP3P42574 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP3P42574 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP3P42574 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP3P42574 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP3P42574 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP3P42574 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP3P42574 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP3P42574 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP3P42574 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP3P42574 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP3P42574 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP3P42574 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP3P42574 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP3P42574 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP3P42574 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP3P42574 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP3P42574 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP3P42574 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP3P42574 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP3P42574 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP3P42574 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP3P42574 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP3P42574 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP3P42574 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP3P42574 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP3P42574 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP3P42574 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP3P42574 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP3P42574 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP3P42574 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP3P42574 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP3P42574 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP3P42574 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP3P42574 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP3P42574 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP3P42574 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP3P42574 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP3P42574 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP3P42574 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP3P42574 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP3P42574 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP3P42574 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP3P42574 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP3P42574 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP3P42574 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP3P42574 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP3P42574 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP3P42574 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP3P42574 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP3P42574 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP3P42574 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP3P42574 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP3P42574 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP3P42574 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP3P42574 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP3P42574 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP3P42574 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP3P42574 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP3P42574 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP3P42574 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP3P42574 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP3P42574 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP3P42574 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP3P42574 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP3P42574 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASP3P42574 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP3P42574 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP3P42574 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP3P42574 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP3P42574 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP3P42574 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP3P42574 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP3P42574 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP3P42574 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP3P42574 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP3P42574 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP3P42574 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP3P42574 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP3P42574 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP3P42574 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms