Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFSF9P41273 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 403.1 ms