Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDSP41222 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms