Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDH1P40925 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDH1P40925 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDH1P40925 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDH1P40925 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDH1P40925 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH1P40925 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDH1P40925 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDH1P40925 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDH1P40925 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDH1P40925 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDH1P40925 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDH1P40925 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDH1P40925 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDH1P40925 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MDH1P40925 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDH1P40925 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDH1P40925 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDH1P40925 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDH1P40925 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MDH1P40925 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDH1P40925 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDH1P40925 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDH1P40925 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDH1P40925 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDH1P40925 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDH1P40925 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDH1P40925 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDH1P40925 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDH1P40925 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDH1P40925 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDH1P40925 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDH1P40925 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDH1P40925 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDH1P40925 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDH1P40925 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDH1P40925 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDH1P40925 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDH1P40925 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDH1P40925 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDH1P40925 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDH1P40925 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDH1P40925 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDH1P40925 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDH1P40925 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDH1P40925 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDH1P40925 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDH1P40925 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDH1P40925 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDH1P40925 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDH1P40925 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDH1P40925 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDH1P40925 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDH1P40925 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDH1P40925 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDH1P40925 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDH1P40925 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDH1P40925 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDH1P40925 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDH1P40925 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDH1P40925 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDH1P40925 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDH1P40925 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDH1P40925 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDH1P40925 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDH1P40925 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH1P40925 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDH1P40925 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDH1P40925 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDH1P40925 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDH1P40925 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDH1P40925 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDH1P40925 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDH1P40925 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDH1P40925 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDH1P40925 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDH1P40925 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms