Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC26A3P40879 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC26A3P40879 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms