Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH1P40692 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH1P40692 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH1P40692 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH1P40692 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH1P40692 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH1P40692 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLH1P40692 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH1P40692 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH1P40692 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH1P40692 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLH1P40692 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH1P40692 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH1P40692 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH1P40692 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH1P40692 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH1P40692 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH1P40692 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLH1P40692 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH1P40692 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH1P40692 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH1P40692 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH1P40692 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH1P40692 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH1P40692 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MLH1P40692 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH1P40692 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH1P40692 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH1P40692 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH1P40692 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH1P40692 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH1P40692 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH1P40692 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH1P40692 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH1P40692 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH1P40692 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH1P40692 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH1P40692 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH1P40692 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH1P40692 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH1P40692 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH1P40692 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH1P40692 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH1P40692 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH1P40692 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH1P40692 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH1P40692 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH1P40692 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH1P40692 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH1P40692 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH1P40692 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH1P40692 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH1P40692 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH1P40692 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH1P40692 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH1P40692 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH1P40692 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH1P40692 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH1P40692 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH1P40692 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH1P40692 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH1P40692 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH1P40692 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH1P40692 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH1P40692 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH1P40692 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH1P40692 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH1P40692 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH1P40692 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH1P40692 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH1P40692 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH1P40692 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH1P40692 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH1P40692 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH1P40692 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH1P40692 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH1P40692 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH1P40692 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH1P40692 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH1P40692 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH1P40692 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH1P40692 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH1P40692 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH1P40692 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH1P40692 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH1P40692 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH1P40692 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH1P40692 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH1P40692 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms